Церковь Рождества Пресвятой Богородицы построена в 1689 году тщанием царского стольника Феодора Иванова Космина. Род Косминых, владевших Костино около ста лет, вплоть до середины XVIII века, происходил из новгородских бояр. Феодор Иоанович начал возводить Богородицерождественскую церковь после смерти своего отца.
По названию церкви само село Костино тоже стало называться Богородское.
Последним владельцем усадьбы с 1901 по 1918 годы был Потомственный Почетный Гражданин, награжденный Золотой медалью на Анненской ленте, Александр Николаевич Крафт, который в 1903 году стал церковным старостой.
